Искусственные нейроны сохраняют черты эмбрионального развития
- CNews FORUM 12 ноября
- CNews AWARDS 12 ноября
- Школа Роста
- СУБД в эпоху ИИ
- КИИ в облаке
- 10 лет российского бэкапа
- SDN: Сеть как дом
- История облаков
- 30 лет ERP России
- Цифровизация
- Импортозамещение
- Безопасность
- ИТ в госсекторе
- ИТ в банках
- ИТ в торговле
- Телеком
- ИТ-бизнес
- Рейтинги
|
Ученые «Сколтеха» (институт входит в группу ВЭБ.РФ) совместно с коллегами из Института проблем передачи информации имени А. А. Харкевича РАН, МГУ имени М. В. Ломоносова и других организаций провели сравнительное исследование трехмерной организации генома в нейронах, полученных из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, и в нейронах взрослого мозга человека. Авторы собрали и обработали более 300 карт 3D-генома, охватывающих 62 образца человека и 34 образца мыши, включая данные по эмбриональным стволовым клеткам, индуцированным плюрипотентным стволовым клеткам, нейральным прогениторам, фетальным и постмортальным нейронам, а также нейронам, дифференцированным in vitro. В работе также представлены пять новых карт 3D-генома, полученных авторами. Исследование опубликовано в журнале Genome Research. Об этом CNews сообщили представители «Сколтеха».
Индуцированные плюрипотентные стволовые клетки — это клетки, полученные из взрослых соматических клеток путём генетического перепрограммирования, которое возвращает их в состояние, подобное эмбриональному. Из таких клеток можно дифференцировать нейроны, генетически идентичные донору, что позволяет изучать заболевания нервной системы в лабораторных условиях. Однако до сих пор оставалось неясным, насколько полно такие нейроны воспроизводят архитектуру хроматина зрелых нейронов взрослого мозга.
Анализ показал, что нейроны, дифференцированные из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, по своим хроматиновым свойствам ближе к клеткам-предшественникам нейронов, чем к зрелым нейронам. В этих клетках активные и неактивные участки генома разделены более отчётливо, а границы структурных доменов (участков, где ДНК взаимодействует сама с собой) содержат гены, связанные с развитием. При этом длинные репрессивные контакты, которые в зрелых нейронах подавляют гены на расстоянии, в искусственно выращенных нейронах выражены гораздо слабее. Сами структурные домены в таких нейронах меньше и имеют более плотную упаковку, что характерно для клеток-предшественников. Кроме того, в них снижена активность часто взаимодействующих регуляторных участков, которые в норме контролируют экспрессию генов.
Low/no-code-революция: новая архитектура цифровой независимости Конференция
«Полученные данные показывают, что нейроны, выращенные из индуцированных плюрипотентных стволовых клеток, не достигают зрелой архитектуры хроматина, характерной для взрослого мозга. Они сохраняют черты, присущие ранним стадиям развития, что ограничивает их использование для моделирования заболеваний с поздним началом, таких как, например, нейродегенеративные. Вместе с тем те же самые незрелые свойства делают их пригодными для изучения развития нервной системы и регуляторных механизмов, критических на ранних этапах онтогенеза», — сказала Екатерина Храмеева, научный руководитель работы, доцент Центра био- и медицинских технологий «Сколтеха».
«Мы создали базу данных карт 3D-генома нейрональных клеток человека и мыши, которая доступна исследовательскому сообществу. Это позволило нам впервые систематически сравнить 3D-организацию генома дифференцированных нейронов, сопоставив их как с постмортальными нейронами, так и с клетками-предшественниками. Мы показали, что на каждом из уровней дифференцированные нейроны отличаются от зрелых и сохраняют профиль клеток-предшественников. Эти выводы дают исследователям практические критерии для выбора модели в зависимости от поставленной задачи: для одних вопросов дифференцированные нейроны подходят, для других — нет», — осказала Диана Загирова, первый автор работы, младший научный сотрудник Центра био- и медицинских технологий «Сколтеха», выпускница магистратуры «Сколтеха» «Науки о жизни».
KioskNews shows a cleaned-up reading view extracted from the publisher’s page — the original always lives on their site, not ours.